Τα συμπτώματα της ελονοσίας περιλαμβάνουν πυρετό και κλινικές εκδηλώσεις παρόμοιες με της γρίπης, όπως κρυάδες, πονοκέφαλο, μυαλγίες και κούραση. Άλλα συμπτώματα που μπορεί να εκδηλωθούν είναι ναυτία, διάρροια και εμετός. Η ελονοσία μπορεί επίσης να προκαλέσει αναιμία και ίκτερο (κιτρίνισμα του δέρματος και των ματιών), εξαιτίας της απώλειας ερυθρών αιμοσφαιρίων. Η λοίμωξη από έναν συγκεκριμένο τύπο παράσιτου της ελονοσίας, τον Plasmodium falciparum, σε περίπτωση που δεν αντιμετωπιστεί έγκαιρα, μπορεί να προκαλέσει νεφρική ανεπάρκεια, κρίσεις, νοητική σύγχυση, κώμα, ακόμη και θάνατο.